Los sistemas de control interno supervisan actos de la administración pública, procurando que los mismos estén subordinados a la legalidad, transparencia y servicio público, hecho que no se constata en países latinoamericanos. El propósito de este artículo fue analizar el control interno en Ecuador, reflexionando sobre cómo está regulado legalmente y su vinculación con la profesionalización de los servidores públicos, para ello, se utilizó un diseño documental, utilizando el método analítico sintético, sistémico y exegético que conllevó como resultado una efectiva relación, proponiendo que se legalice el sistema de profesionalización de los servidores públicos, en lugar del sistema de carrera para así contribuir al logro del objetivo del control interno.